2020 生物信息学基础（宋永波）(沈阳药科大学) 最新满分章节测试答案

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本课程起止时间为:2020-03-02到2020-06-30
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第二章：生物数据库（第一部分） 单元测验02

1、 问题:FASTA序列格式以哪个符号开头？
选项：
A:>
B:<
C:#
D:*
答案: 【>】

2、 问题:从GenBank的哪一项注释中可以找到关于编码蛋白的信息？
选项：
A:SOURCE
B:RBS
C:CDS
D:ORIGIN
答案: 【CDS】

3、 问题:以下关于GenBank的描述，哪个是正确的？
选项：
A:GenBank里的一条数据库记录对应一个完整的基因。
B:GenBank里的一条数据库记录可能只包含某个基因的一部分。
C:真核生物的基因经常是分段存储在多条GenBank数据库记录里。
D:真核生物的基因都是整个存储在GenBank的一条数据库记录里。
E:原核生物的基因都是分片段存储在多条GenBank数据库记录里。
F:真核生物的基因以外显子为单位，一条数据库记录存储一个外显子。
答案: 【GenBank里的一条数据库记录可能只包含某个基因的一部分。;
真核生物的基因经常是分段存储在多条GenBank数据库记录里。】

4、 问题:以下哪个是NCBI下属的数据库？
选项：
A:GenBank
B:RefSeq
C:Gene
D:dbEST
E:Ensemble
F:HMP
G:ncRNA
H:Uniprot
答案: 【GenBank;
RefSeq;
Gene;
dbEST;
ncRNA】

5、 问题:关于HMP的描述，以下哪个是正确的？
选项：
A:HMP是人类微生物组学计划
B:HMP目前已包括人类所有器官的微生物宏基因组样本数据
C:HMP由J. Craig Venter Institute独立完成
D:HMP是人类基因组计划
答案: 【HMP是人类微生物组学计划】

6、 问题:以下关于PubMed的描述错误的是
选项：
A:任何生命科学领域的论文都可以从PubMed下载全文
B:PublMed是生物医学文献数据库
C:PubMed提供文章摘要和全文链接
D:1965年以前的文献没有被收录到PubMed里
答案: 【任何生命科学领域的论文都可以从PubMed下载全文】

7、 问题:以下哪些数据库是核酸数据库？
选项：
A:GenBank
B:EMBL-ENA
C:DDBJ
D:Swissprot
E:TrEMBL
F:Uniprot
G:PDB
H:SCOP
I:CATH
J:NCBI-Gene
答案: 【GenBank;
EMBL-ENA;
DDBJ;
NCBI-Gene】

8、 问题:以下关系式正确的是？
选项：
A:1G=1,000,000K
B:1T=1,000G
C:1T=1,000,000,000K
D:1T=1,000,000M
E:1G=1,000M
F:1G=1,000,000M
G:1G=1,000T
H:1T=1,000,000K
I:1M=1,000T
J:1T=1,000,000,000,000K
答案: 【1G=1,000,000K;
1T=1,000G;
1T=1,000,000,000K;
1T=1,000,000M;
1G=1,000M】

9、 问题:GenBank数据库中的检索号（Accession）和基因座名（Locus）指的都是一条序列在数据库中的编号，他们永远都是相同的。
选项：
A:正确
B:错误
答案: 【错误】

10、 问题:当一个序列发生了改变，它的GenBank检索号（Accession）不变，但会被赋予一个新的GI号。
选项：
A:正确
B:错误
答案: 【正确】

11、 问题:对于GenBank的一条数据库记录，只要版本号（Version）增加，必然会产生一个新的GI号。
选项：
A:正确
B:错误
答案: 【正确】

12、 问题:GenBank里的一个序列因发生变化而被赋予新的GI号时，检索号（Accession）和版本号（Version）都不发生改变。
选项：
A:正确
B:错误
答案: 【错误】

【作业】第二章：生物数据库（第二部分） 单元作业01

1、 问题:请从UniprotKB（http://www.uniprot.org ） 数据库中查看编号为P62694的蛋白质的详细信息：（1）这个蛋白质的中文名字是什么，它属于：植物，动物，还是真菌（1分）？（2）该蛋白质的亚细胞定位是什么（1分）？（3）请找出该蛋白所包含的信号肽的氨基酸序列（1分）？（4）这个蛋白质包含一个叫CBM1的结构域，该结构域在纤维素酶降解不可溶纤维素中起着重要的作用。请找出这个结构域在该蛋白质氨基酸序列中的位置（1分）。（5）找出该蛋白质CBM1结构域在PDB数据库中对应的相关三级结构，写出PDB_ID，贴出结构图片，说出解析该结构所使用的实验方法（1分）。
评分规则: 【 这个蛋白质的中文名字是什么，它属于：植物，动物，还是真菌？要点：需要将英文名字翻译成中文。选择正确的物种分类，三选一。正确答案：中文名字=外切葡聚糖酶，它属于=真菌。
该蛋白质的亚细胞定位是什么？要点：写出正确的亚细胞定位，中文或英文皆可。正确答案：亚细胞定位=Extracellular region or secreted（细胞外/分泌途径）
请找出该蛋白所包含的信号肽的氨基酸序列？要点：写出正确的氨基酸序列，错写，漏写不得分。正确答案：信号肽序列=MYRKLAVISAFLATARA
这个蛋白质包含一个叫CBM1的结构域，该结构域在纤维素酶降解不可溶纤维素中起着重要的作用。请找出这个结构域在该蛋白质氨基酸序列中的位置。要点：需要写出结构域正确的起始位置号和结束位置号，比如：123到456，错写，漏写不得分。正确答案：CBM1结构域的位置=477到513
找出该蛋白质CBM1结构域在PDB数据库中对应的相关三级结构，写出PDB_ID，贴出结构图片，说出解析该结构所使用的实验方法。要点：找出的结构需为CBM1结构域的结构，如不是不得分。CBM1结构域在PDB数据库中对应的PDB_ID不唯一。正确答案举例：PDB_ID=1AZ6，解析方法=NMR（核磁共振法），结构图片=
】

第二章：生物数据库（第二部分） 单元测验03

1、 问题:以下关于Swiss-Prot数据库和TrEMBL数据库的描述错误的是：
选项：
A:Swiss-Port和TrEMBL同属于UniProtKB数据库
B:Swiss-Port是手动完成的注释，TrEMBL是自动完成的注释‍
C:Swiss-Prot包含的序列少，TrEMBL包含的序列多
D:TrEMBL数据量大，其中也包含Swiss-Prot里的序列‍
E:Swiss-Port是自动完成的注释，TrEMBL是手动完成的注释
F:TrEMBL数据量大，但并不包含Swiss-Prot里的序列
答案: 【TrEMBL数据量大，其中也包含Swiss-Prot里的序列‍;
Swiss-Port是自动完成的注释，TrEMBL是手动完成的注释】

2、 问题:以下哪个生物数据库提供信号传导通路信息？
选项：
A:Swiss-Prot
B:Pfam
C:DDBJ
D:PDB
E:KEGG
F:OMIM
G:GenBank
H:KEGG Pathway
答案: 【KEGG;
KEGG Pathway】

3、 问题:以下不是非冗余的蛋白质/核酸数据库的是：
选项：
A:RefSeq
B:UniProtKB TrEMBL‍
C:UniProtKB Swiss-Prot‍
D:UniRef
答案: 【UniProtKB TrEMBL‍】

4、 问题:全世界唯一存储生物大分子3D结构的数据库是：
选项：
A:UniProtKB
B:PDB
C:KEGG
D:OMIM
E:Pfam
F:CATH
G:Ensemble
H:DDBJ
答案: 【PDB】

5、 问题:PDB文件是如何存储蛋白质3D结构的？
选项：
A:通过存储GIF动画
B:通过存储氨基酸序列
C:通过存储全息影像
D:通过存储蛋白质中每个原子的3D坐标
答案: 【通过存储蛋白质中每个原子的3D坐标】

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